More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3681 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  100 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 144 aa  83.6  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  35.61 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  36.72 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1016 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  32.54 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  33.88 
 
 		 320 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  35.48 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  34.43 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  29.6 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  33.59 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  32.06 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1002 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  30.25 
 
 		 1364 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 602 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1177 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 1816 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  32.23 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1333 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1034  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03214  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 		 852 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal  0.573276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0442  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0489543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  26.87 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1159 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 778 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00947  Signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000206574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  27.42 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.98 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  24.19 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  27.42 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  27.42 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  28.46 
 
 		 1137 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3975  response regulator receiver domain-containing protein  28.23 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 1137 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  27.34 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  27.2 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 922 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  27.42 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  22.58 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  24 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 503 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 1309 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  27.42 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 922 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 963 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  26.77 
 
 		 531 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 948 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  24 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  29.27 
 
 		 650 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 948 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 896 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 896 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  26.61 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  32.48 
 
 		 896 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1071 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  31.36 
 
 		 1071 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  29.84 
 
 		 1161 aa  53.9  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 1055 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 896 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  32.48 
 
 		 896 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>