More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1955 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  259  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  33.06 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  28.68 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  31.45 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  27.13 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  35.2 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  32.03 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.25 
 
 		 1871 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.46 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  29.92 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  31.9 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  31.09 
 
 		 1351 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  36.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 899 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.13 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  30.36 
 
 		 671 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  29.84 
 
 		 1082 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  29.84 
 
 		 1082 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1202 aa  53.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1082 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1309 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 802 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  38.24 
 
 		 2035 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  35.43 
 
 		 818 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.71 
 
 		 852 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  26.23 
 
 		 320 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  30.16 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  33.33 
 
 		 735 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 790 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1452 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  31.67 
 
 		 795 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 903 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45485  ethylene receptor 1  31.09 
 
 		 833 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 224 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 782 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  44.62 
 
 		 1118 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 503 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 644 aa  50.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1266 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  34.4 
 
 		 691 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00947  Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000206574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 376 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  38.24 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1305 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0891  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.21 
 
 		 376 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00461138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4516  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  46.97 
 
 		 1137 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1016 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  28.32 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 833 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  30.51 
 
 		 676 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02581  Histidine kinase G7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ25]  30.3 
 
 		 1282 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.677221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 370 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0043  chemotaxis response regulator, CheY6  31.67 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1678  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0112652  hitchhiker  0.00414456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 787 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  29.27 
 
 		 331 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  31.03 
 
 		 891 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 572 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 690 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.46 
 
 		 331 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 		 1791 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1631  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  24.78 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  30.16 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  28.68 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.03 
 
 		 331 aa  48.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.4 
 
 		 763 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>