More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3604 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  55.64 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  54.29 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  54.41 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  54.01 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  54.41 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  54.41 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  53.68 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544.1  hypothetical protein  53.57 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  50.74 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  52.14 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  48.53 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  50 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  47.1 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  46.1 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  45.52 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  41.54 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  41.54 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  43.61 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  40 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  39.42 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  39.19 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  41.1 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  40.6 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  43.09 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  43.09 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  38.35 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  41.48 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  36.17 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  35.97 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  36.69 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  37.23 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  36.55 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.5 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.33 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.46 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  33.11 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>