More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3162 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  64.75 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  64.54 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  65.94 
 
 		 144 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  65.22 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  65.22 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  65.94 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  65.94 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  65.94 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544.1  hypothetical protein  64.03 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  52.14 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  52.24 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  50 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  50.72 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  49.26 
 
 		 141 aa  137  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  44.37 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  42.54 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  40.77 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  40.77 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  35.56 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  41.04 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  40.35 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  40.18 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 152 aa  84.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.76 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  38.6 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  35.04 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  35.04 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  35.04 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  35.04 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  35.81 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  35.04 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  35.04 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  35.04 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 144 aa  83.6  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  39.29 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  32.12 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.64 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  35.17 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  32.87 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  34.04 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35.97 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  32.61 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  34.81 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  33.59 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  32.56 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.35 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>