More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2787 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  47.06 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  38.52 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544.1  hypothetical protein  40.83 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  37.12 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  37.88 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  37.12 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  34.65 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  37.93 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  33.63 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  32.74 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  33.04 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  32.73 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  32.48 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  33.61 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 531 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  32.48 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  27.91 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  34.81 
 
 		 792 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 803 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  30 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0826  response regulator receiver domain-containing protein  35.05 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  30.83 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  30.97 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  30 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1314 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.28 
 
 		 2301 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  30.15 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1432  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  30.71 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 509 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.68 
 
 		 425 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_002936  DET1540  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.53 
 
 		 314 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.7 
 
 		 590 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0824  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0263767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  37.36 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 798 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 306 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2120  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 238 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  32.46 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2537  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 242 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  23.7 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.46 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  34.94 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>