More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2083 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  288  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  97.84 
 
 		 139 aa  286  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  41.6 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  40.98 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  41.03 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  41.03 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  43.09 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  36.29 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  33.91 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  34.75 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  35.09 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  33.07 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  30.4 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  38.54 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  35 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 531 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1201 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  30.4 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  30.71 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  33.05 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1120  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 989 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 989 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  32.17 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  29.69 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1137 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1125 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544.1  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  32.12 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>