More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1120 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1120  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2024  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 211 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 211 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4555  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2635  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0563539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  34.51 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4221  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 434 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1012  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175734  normal  0.0400951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1290  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398519  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.04 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  32.43 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  34.82 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  34.82 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  35.19 
 
 		 705 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  44.58 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0584  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2816  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.815193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1682  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.86 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000361446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  36.75 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2200  transcriptional regulatory protein YedW  34.86 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000454941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2748  transcriptional regulatory protein YedW  34.86 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892088  normal  0.227347 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1676  transcriptional regulatory protein YedW  34.86 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000350308  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2070  transcriptional regulatory protein YedW  34.86 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.15395e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1216  transcriptional regulatory protein YedW  34.86 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000203871  normal  0.637592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1322 aa  67.8  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0914  transcriptional regulatory protein YedW  34.86 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01884  predicted DNA-binding response regulator in two-component system with YedV  34.86 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000533293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 383 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01874  hypothetical protein  34.86 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000061937  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  31.93 
 
 		 1361 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 411 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 383 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  30.51 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 263 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.74 
 
 		 1177 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.76 
 
 		 243 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  36.11 
 
 		 705 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  31.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1631 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 		 593 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1128 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2721  response regulator receiver protein  35 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 721 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 		 593 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1362 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  31.62 
 
 		 1111 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  33.96 
 
 		 513 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  32.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  32.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  32.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 454 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  39.78 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  32.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.75 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  32.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  32.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>