More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2024 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2024  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1120  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 209 aa  88.2  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 221 aa  87.4  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 211 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 211 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2365  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.878823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1814  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.948261  normal  0.399869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1012  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175734  normal  0.0400951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1362 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  37.38 
 
 		 1361 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  34.85 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 927 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  32.81 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  32.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  34.85 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 984 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 687 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  32.77 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  32.77 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  40.24 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 1201 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 970 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.28 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1613  response regulator receiver domain-containing protein  32.97 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  33.75 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 933 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  26.19 
 
 		 998 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  34.56 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  32.21 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 232 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1271 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1651 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.88 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1361 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  34.57 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  30.43 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  31.19 
 
 		 619 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  31.58 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  30.25 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2999  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.669597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 823 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  31.01 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1478  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1472  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.79 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>