More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1618 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  63.11 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  61.88 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  60.29 
 
 		 211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  60.29 
 
 		 211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2365  response regulator receiver protein  50 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.878823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1478  response regulator receiver protein  47.09 
 
 		 426 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  46.95 
 
 		 411 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 140 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1472  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1613  response regulator receiver domain-containing protein  38.04 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 531 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 278 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.65 
 
 		 488 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 566 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  88.2  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 225 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.78 
 
 		 350 aa  88.2  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 254 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.8 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.61 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  37.01 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  37.01 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1572  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.734194  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  37.01 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  37.01 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.14 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  37.01 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 225 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  36.92 
 
 		 242 aa  84.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  84.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  36.22 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  37.3 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  33.33 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  39.83 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  36.29 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  35.38 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1609 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  36.6 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 858 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  35.09 
 
 		 1127 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  34.62 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  39.23 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.23 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 383 aa  82.4  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  36.67 
 
 		 705 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  33.61 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.92 
 
 		 1301 aa  82  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1290  response regulator receiver domain-containing protein  27.36 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398519  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  32.77 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.92 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  32.6 
 
 		 384 aa  81.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 407 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  35.83 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  37.5 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  36.67 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>