More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1290 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1290  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398519  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1572  response regulator receiver domain-containing protein  43.41 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.734194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  30.46 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  27.36 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1613  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  25.12 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  36.11 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  35.4 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  35.4 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  38.14 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0390  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  27.92 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0687003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0985  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.758318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059  two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  25.84 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1120  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  27.85 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1080 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3881  winged helix family two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2365  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.878823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 124 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0908  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5849  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.89 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3054  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.82 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 1588 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  36.7 
 
 		 513 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.29 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  27.03 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  27.03 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  27.45 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  27.03 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1472  response regulator receiver domain-containing protein  30.33 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3074  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310248  normal  0.0100443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  33.65 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  30.4 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  36.45 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 		 1127 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  33.65 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  25.56 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C61  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  32.69 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  32.69 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0886  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384988  normal  0.153587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  31.73 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  26.02 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3677  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  36.45 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0435  two component transcriptional regulator  31.07 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.583358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  32.69 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  34.19 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  26.79 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.04 
 
 		 385 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  28.77 
 
 		 667 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 455 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  26.34 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  26.79 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  26.79 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>