More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0319 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  73.48 
 
 		 230 aa  342  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  45.5 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  45.05 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  47.37 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.92 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  43.81 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  45.13 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 244 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  48.03 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  48.03 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  45.24 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  42.22 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  44.74 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 228 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  50.22 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  48.44 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.92 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.92 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.92 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.92 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.92 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.92 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.3 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  47.09 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  47.62 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.75 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.75 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  45.37 
 
 		 249 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  48.23 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.49 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  43.67 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  43.56 
 
 		 247 aa  175  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  41.38 
 
 		 245 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  41.38 
 
 		 245 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 243 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  44.1 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  44.54 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  44.98 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  44.44 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 256 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  42.6 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  43.24 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  43.23 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  43.42 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  43.23 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  43.67 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>