More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6517 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
228 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  95.61 
 
 
228 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  69.74 
 
 
228 aa  321  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  63.6 
 
 
229 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  65.79 
 
 
246 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  64.63 
 
 
249 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  61.11 
 
 
230 aa  284  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  61.84 
 
 
229 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  59.23 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  58.8 
 
 
233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  59.57 
 
 
230 aa  267  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.26 
 
 
226 aa  244  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  50.66 
 
 
232 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  50.22 
 
 
232 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
226 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 
226 aa  222  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  50.88 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
227 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  47.56 
 
 
227 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  48.2 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  48.2 
 
 
226 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 
226 aa  218  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 
232 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  47.56 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  50.22 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  47.53 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.58 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.02 
 
 
232 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.34 
 
 
232 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 
232 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  47.14 
 
 
229 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 
238 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 
232 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 
232 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 
232 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  46.26 
 
 
229 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
235 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
230 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 
244 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.64 
 
 
228 aa  201  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  50 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  45.74 
 
 
226 aa  198  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  44.35 
 
 
247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  45.09 
 
 
225 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
227 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 
235 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  47.09 
 
 
227 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
227 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
227 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 
234 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
223 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
230 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 
234 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  46.01 
 
 
236 aa  184  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  45.13 
 
 
225 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  45.13 
 
 
225 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 
229 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  42.36 
 
 
242 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
225 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
225 aa  177  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
231 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
231 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1624  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.57 
 
 
278 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
225 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 
247 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 
227 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
231 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  41.81 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  41.81 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  41.81 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>