More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3846 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  49.34 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  48.44 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  48 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  46.15 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  47.37 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.6 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  46.82 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  45.29 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.88 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  44.34 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  44.59 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  44.34 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.79 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  41.63 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3589  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.55 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110518  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  42.6 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  40.6 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  43.89 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  42.79 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1806  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.69 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.69 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.69 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  41.07 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  41.15 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  42.02 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.04 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.59 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.54 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  42.24 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.99 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  42.29 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 241 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  43.64 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.81 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>