More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4033 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  92.67 
 
 		 232 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  90.52 
 
 		 232 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  95.69 
 
 		 232 aa  424  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  88.36 
 
 		 232 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.5 
 
 		 232 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.5 
 
 		 232 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.5 
 
 		 232 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.5 
 
 		 232 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.5 
 
 		 232 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.83 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.83 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.83 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  87.07 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  87.07 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  59.83 
 
 		 229 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  60.7 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  58.95 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  58.44 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  56.77 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  59.39 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 227 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 228 aa  248  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  57.02 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  56.52 
 
 		 226 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0254  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000326652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0261  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 228 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000347248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0256  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.77 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000272342  decreased coverage  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0261  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000361731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  51.29 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4477  transcriptional regulatory protein CpxR  57.89 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0252  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000571082  hitchhiker  0.000346333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3769  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000556998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0253  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0367  two component transcriptional regulator  57.46 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000100212  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.1 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  50.22 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  47.81 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  47.81 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  49.78 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  46.09 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  48.92 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 232 aa  204  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  47.19 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  44.98 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  45.11 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.45 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  45.91 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  45.13 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  43.61 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.74 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  46.05 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  45.61 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.98 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.61 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>