More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4460 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  453  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.41 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  53.54 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  52.81 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  51.13 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  50.68 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.85 
 
 		 226 aa  231  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.67 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  53.57 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  47.56 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  48.89 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  48.68 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  47.56 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  50 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.47 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.12 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1624  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.2 
 
 		 278 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  47.09 
 
 		 227 aa  208  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  47.09 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  43.91 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  48.21 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  48.44 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  48.25 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  46.89 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  47.98 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.81 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.81 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.81 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.81 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.81 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.25 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  46.9 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.37 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.12 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.12 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.12 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.56 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.68 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  47.37 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  46.93 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 262 aa  191  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  46.93 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  45.41 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  45.22 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  45.41 
 
 		 243 aa  187  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  45.41 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  45.41 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  45.22 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>