More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3275 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.59 
 
 		 226 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.65 
 
 		 226 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.76 
 
 		 226 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  77.88 
 
 		 226 aa  360  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  77.97 
 
 		 227 aa  356  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  77.97 
 
 		 227 aa  356  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  77.09 
 
 		 227 aa  352  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  48.66 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  45.98 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  47.32 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  47.32 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  47.32 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.42 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  46.4 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  43.81 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  45.28 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  43.05 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.79 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  41.96 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  41.96 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1624  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  40 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  44.59 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  41.63 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  40.99 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.33 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.33 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.42 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 236 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  43.75 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2740  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307567  normal  0.0284463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.67 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 227 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.22 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.22 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.22 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.22 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.22 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.54 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.56 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.22 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.33 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1806  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>