More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3074 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3074  response regulator receiver protein  100 
 
 		 200 aa  394  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310248  normal  0.0100443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  92  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  37.61 
 
 		 121 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  37.29 
 
 		 120 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  36.13 
 
 		 121 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 128 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 121 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  36.75 
 
 		 121 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  88.6  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  87.8  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  37.29 
 
 		 121 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 121 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 125 aa  84.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  84.7  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 120 aa  84.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  36.44 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  36.21 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 125 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 125 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  36.21 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  35.34 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  36.21 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  33.05 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  33.62 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  33.04 
 
 		 116 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  34.48 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  34.48 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  38.74 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  32.76 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  33.62 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 398 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  33.62 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  35.48 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  35.48 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  39.25 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  39.25 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  39.25 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>