More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3816 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  88.33 
 
 		 120 aa  213  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  72.81 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  70.18 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  70.18 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  70.18 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  70.18 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  70.18 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  70.18 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  70.18 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  68.03 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  64.75 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  53.39 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  55.17 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  55.08 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  54.7 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  55.65 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  54.78 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  56.76 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  53.15 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  52.59 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  48.74 
 
 		 121 aa  120  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  53.45 
 
 		 123 aa  120  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  50.43 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  51.3 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  47.46 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  46.61 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  50.82 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  45.38 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  51.79 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  51.28 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  46.79 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  51.85 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  52.63 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  47.41 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  45.38 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  51.4 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  45.45 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  50.47 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  50.47 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  46.15 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  45 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  45 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  43.97 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  46.85 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  37.19 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>