More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2638 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2365  response regulator receiver protein  30.27 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.878823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 411 aa  92.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1472  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1478  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1572  response regulator receiver domain-containing protein  29.49 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.734194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1613  response regulator receiver domain-containing protein  29.71 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 858 aa  78.6  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 122 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 122 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1290  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398519  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  28.8 
 
 		 919 aa  72  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 934 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4555  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1651 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 807 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 		 969 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  32.14 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 381 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.3 
 
 		 2099 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 128 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4464  response regulator receiver domain-containing protein  30.34 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 798 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2024  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  24.6 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1120  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 955 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  30.09 
 
 		 971 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  28.08 
 
 		 1296 aa  66.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1492  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1029 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  32.2 
 
 		 998 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 984 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 933 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  31.09 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.87 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 382 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  33.33 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1362 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  30.25 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 803 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 970 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 975 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  30.91 
 
 		 1361 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 962 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 1002 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 1857 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 1021 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  30.58 
 
 		 792 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0652  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.82 
 
 		 2099 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.17 
 
 		 1131 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1131 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.18 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.93 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.6 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.7 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 927 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>