More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0693 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3619  response regulator receiver protein  53.48 
 
 		 647 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  100 
 
 		 639 aa  1285    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  94.84 
 
 		 639 aa  1199    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1267 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  31.73 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  31.73 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  31.79 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  31.73 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  31.73 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 229 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.7 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 237 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 934 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29000  sigma54-dependent response regulator, two-component  44.95 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.99042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  31.25 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  31.18 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  33.33 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 234 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  30.5 
 
 		 240 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0895  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 250 aa  72.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 640 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 235 aa  72  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 777 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  36.89 
 
 		 248 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0328  DNA-binding response regulator OmpR  36.43 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0258  osmolarity response regulator  36.43 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.2 
 
 		 890 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  28.71 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  33.14 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  30.24 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  30.64 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  29.48 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  31.19 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2062  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.89 
 
 		 449 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000496565 
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  37.82 
 
 		 228 aa  70.1  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 272 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  35 
 
 		 122 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 236 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  31.41 
 
 		 239 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  31.22 
 
 		 240 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2984  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.07 
 
 		 458 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.826768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  30.24 
 
 		 241 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.17 
 
 		 819 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 131 aa  70.5  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 233 aa  70.5  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3340  response regulator receiver  32.84 
 
 		 131 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 511 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  33.88 
 
 		 1287 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  32.74 
 
 		 125 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0260  osmolarity response regulator  35.66 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948807  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 132 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  34.44 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 233 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 121 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 233 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  33.05 
 
 		 227 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36 
 
 		 243 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 127 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.52 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0538681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 128 aa  69.3  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 964 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  36.36 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  36.89 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 923 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 772 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>