More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1572 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1572  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.734194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1290  response regulator receiver domain-containing protein  43.41 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398519  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1613  response regulator receiver domain-containing protein  28.66 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  29.49 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  27.93 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  27.98 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  34.88 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  27.48 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  27.98 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  34.45 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  28.91 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  32.17 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2365  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.878823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  41.41 
 
 		 912 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  27.48 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.79 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1478  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  33.06 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  31.47 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0985  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 402 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.758318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  33.33 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  33.33 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  28.71 
 
 		 411 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  33.33 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.56 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 531 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.21 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3881  winged helix family two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.83 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  31.86 
 
 		 1153 aa  66.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.07 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  36.44 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  32.45 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.38 
 
 		 394 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  30.82 
 
 		 1526 aa  65.1  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 380 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  31.25 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1472  response regulator receiver domain-containing protein  29.3 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  31.67 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  33.81 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  28.47 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0390  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.6 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0687003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  30.34 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 140 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1603  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  24.11 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  27.07 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>