More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1937 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  72.06 
 
 		 212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  65.2 
 
 		 211 aa  292  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  65.2 
 
 		 211 aa  292  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  63.11 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2365  response regulator receiver protein  61.76 
 
 		 221 aa  264  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.878823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  46.86 
 
 		 221 aa  201  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1478  response regulator receiver protein  50 
 
 		 426 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  50.61 
 
 		 411 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 140 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1472  response regulator receiver domain-containing protein  42.44 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1613  response regulator receiver domain-containing protein  33.83 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  39.39 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 367 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 303 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 566 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 488 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 531 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  40.98 
 
 		 170 aa  88.6  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 278 aa  88.6  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 407 aa  88.2  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2024  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 136 aa  88.2  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.35 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 166 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  39.55 
 
 		 312 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  39.5 
 
 		 705 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 397 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1290  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398519  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  41.9 
 
 		 377 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  38.98 
 
 		 125 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  40.68 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  41.67 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.41 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.41 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.17 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  35.76 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  38.66 
 
 		 705 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.7 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0421  response regulatory protein  37.74 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.972098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.5 
 
 		 2284 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 858 aa  81.6  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.21 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  37.5 
 
 		 2301 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 		 339 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  37.19 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 1629 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 977 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  37.19 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 944 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  35.94 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  32.88 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 896 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  33.12 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  39.47 
 
 		 896 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  34.38 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.46 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>