More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4217 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.67 
 
 		 984 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.03 
 
 		 991 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  70.65 
 
 		 796 aa  1085    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  100 
 
 		 792 aa  1595    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  99.75 
 
 		 803 aa  1592    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  92.8 
 
 		 798 aa  1439    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.43 
 
 		 977 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  48.93 
 
 		 970 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 		 917 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 858 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  43.33 
 
 		 998 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 		 1022 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 927 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 791 aa  395  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 1003 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  38.49 
 
 		 910 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 974 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 		 975 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1002 aa  341  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 687 aa  337  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 816 aa  331  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1271 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 1765 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 823 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.07 
 
 		 1763 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1767 aa  321  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1768 aa  317  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 1767 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 1767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1236 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 755 aa  309  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 1771 aa  308  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1267 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 1046 aa  306  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 933 aa  300  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.28 
 
 		 1236 aa  299  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 689 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  31.37 
 
 		 1188 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.54 
 
 		 1765 aa  297  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1236 aa  294  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1236 aa  293  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1236 aa  293  8e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 1234 aa  292  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1064 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  39.64 
 
 		 1361 aa  289  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1362 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1230 aa  288  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1238 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.2 
 
 		 2035 aa  287  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1238 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1238 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1782 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1245 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1784 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1002 aa  284  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1786 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 		 1238 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  29.98 
 
 		 1200 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1234 aa  280  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 1124 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1792 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.26 
 
 		 1135 aa  278  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1303 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1070 aa  275  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1009 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 989 aa  273  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1352 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.36 
 
 		 1233 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 1350 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1245 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 2654 aa  271  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  34.46 
 
 		 1125 aa  270  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1125 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1303 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 984 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 919 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1917 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 1611 aa  269  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 916 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 1141 aa  267  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.03 
 
 		 2213 aa  267  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1202 aa  267  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  29.09 
 
 		 1626 aa  266  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 1622 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1177 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1266 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 647 aa  264  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1165 aa  264  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 647 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.98 
 
 		 1331 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1340 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1172 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 865 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 		 989 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1356 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.49 
 
 		 923 aa  261  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 1363 aa  260  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  32.4 
 
 		 685 aa  260  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1193 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>