More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5225 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  94.33 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  51.77 
 
 		 143 aa  147  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  50.72 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  54.29 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  50 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  50.74 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544.1  hypothetical protein  53.66 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  40.85 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 150 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  37.68 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  41.91 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 165 aa  103  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  39.55 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  42.14 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  40.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  40.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  40.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  40.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  40.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  40.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  40.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  43.26 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  39.29 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  39.44 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  39.42 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  37.23 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  37.31 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  37.21 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  36.57 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  41.22 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  37.69 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.68 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  41.86 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  41.09 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  39.26 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  39.23 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 181 aa  92  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  39.29 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  36.03 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  39.01 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>