298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1314 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  38.58 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  40.35 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  37.6 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  28 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  30.08 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  28.91 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  29.75 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  31.37 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  28.33 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  30.43 
 
 		 320 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  36.46 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  36.46 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 812 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 816 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1384 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  30.47 
 
 		 531 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 1001 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3915  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 839 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 1324 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1330 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  26.27 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  38.46 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  28.32 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 790 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 927 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 1201 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_37014  diatom histidine kinase 2  26.36 
 
 		 791 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.612589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0906  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.1 
 
 		 487 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000910984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  30.23 
 
 		 1834 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 925 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 950 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  38.03 
 
 		 354 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  28.57 
 
 		 367 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  28.57 
 
 		 367 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2289  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 782 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  37.68 
 
 		 1351 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 531 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  30.6 
 
 		 310 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  30 
 
 		 310 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36 
 
 		 322 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 		 1297 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 421 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 566 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.83 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  30.83 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 641 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  32.08 
 
 		 557 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  30.61 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 876 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  27.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  28.15 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0648  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0471753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.08 
 
 		 385 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 796 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 1832 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  29.85 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1199 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  26.72 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  27.72 
 
 		 499 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 1069 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 1369 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>