More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1676 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  274  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5165  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  34.85 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  40.66 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.22 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  30 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1129  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  42.39 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  37.63 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  28.36 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  38.95 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  40.22 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  36.73 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.95 
 
 		 355 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  42.25 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  38 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1909  response regulator receiver protein  37.63 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 911 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 251 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 911 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  36.78 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  29.55 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1517  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.678502  normal  0.344007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  36.56 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  50.77 
 
 		 447 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  28.36 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  29.67 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1961  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 1057 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3679  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 798 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 242 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35.35 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  26.47 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 531 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 		 948 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 370 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 747 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  32.61 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>