More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1961 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1961  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1057 aa  2130    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 1125 aa  247  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 1137 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 		 1736 aa  238  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 1155 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 941 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 1012 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 911 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 911 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.47 
 
 		 1180 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 1078 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 989 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  29.57 
 
 		 2026 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 989 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 2026 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  29.46 
 
 		 1983 aa  212  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 952 aa  212  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 928 aa  211  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  25.08 
 
 		 2325 aa  208  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 1127 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 1065 aa  207  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 1725 aa  207  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  29.87 
 
 		 770 aa  206  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 1098 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 1725 aa  205  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 1098 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  29.17 
 
 		 785 aa  204  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.22 
 
 		 769 aa  201  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  28.89 
 
 		 770 aa  201  7e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 1832 aa  201  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 2414 aa  201  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.21 
 
 		 2301 aa  200  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 1616 aa  199  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.03 
 
 		 769 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 974 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.03 
 
 		 769 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  26.67 
 
 		 2070 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.81 
 
 		 1197 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  30.27 
 
 		 1020 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  28.03 
 
 		 783 aa  198  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  28.57 
 
 		 1989 aa  198  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.16 
 
 		 2284 aa  197  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.5 
 
 		 764 aa  196  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 2022 aa  196  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 2164 aa  194  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.49 
 
 		 2336 aa  194  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  29.14 
 
 		 1643 aa  194  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 977 aa  193  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 740 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 762 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  25.71 
 
 		 1970 aa  193  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 2539 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 2137 aa  192  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 765 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  27.98 
 
 		 2092 aa  191  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  26.88 
 
 		 1956 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 1758 aa  190  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  32.01 
 
 		 878 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 767 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.23 
 
 		 1029 aa  189  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  30.08 
 
 		 793 aa  188  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  26.63 
 
 		 1888 aa  188  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.31 
 
 		 1987 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.04 
 
 		 734 aa  187  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 742 aa  187  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 1609 aa  187  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.73 
 
 		 1960 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 911 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  28.74 
 
 		 774 aa  185  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  27.65 
 
 		 2048 aa  184  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 741 aa  184  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.25 
 
 		 789 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  28.23 
 
 		 803 aa  183  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.34 
 
 		 769 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.4 
 
 		 1866 aa  182  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 2212 aa  181  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 1907 aa  181  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.34 
 
 		 764 aa  181  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1646 aa  181  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 2175 aa  180  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 756 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  27.37 
 
 		 1834 aa  180  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 2423 aa  179  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  27 
 
 		 2301 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 1646 aa  179  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  28.57 
 
 		 2458 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  25.39 
 
 		 974 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 1647 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  28.96 
 
 		 2476 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 1629 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 660 aa  172  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  29.23 
 
 		 752 aa  172  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 784 aa  171  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 1974 aa  171  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  29.17 
 
 		 768 aa  171  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 709 aa  168  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  31.81 
 
 		 754 aa  167  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 777 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 772 aa  167  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>