More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1129 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1129  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  296  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 166 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 196 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5165  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  27.34 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  27.34 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  23.74 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  25 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 778 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  25.37 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  25.56 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  31.25 
 
 		 506 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1287 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  26.4 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  24.82 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.2 
 
 		 464 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  23.19 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 748 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  27.56 
 
 		 748 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  24.29 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  23.91 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  24.82 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  26.23 
 
 		 919 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  23.19 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2102  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  33.75 
 
 		 205 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  22.56 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  24.82 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  28.23 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  26.98 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  24.26 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  35.23 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1599  response regulator receiver protein  23.13 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  21.71 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  21.54 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  22.56 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0415  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  27.64 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  26.98 
 
 		 1225 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  25 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  21.43 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.48 
 
 		 616 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  23.31 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1160 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  24.8 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 768 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  23.57 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  20.3 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2116  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  20.45 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 		 355 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  24.16 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  22.56 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 370 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  24.24 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  22.56 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  27.5 
 
 		 1888 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  23.02 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  22.7 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>