More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0372 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  55.07 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4888  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 196 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.549385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1129  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5165  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4655  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00522257  hitchhiker  0.000000000000410945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5155  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  29.93 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  32.54 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  30 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  32 
 
 		 202 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  29.85 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1599  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  28.26 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  27.82 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  25.55 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  33.33 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  36.28 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  25.18 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  29.91 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  26.09 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  26.67 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 289 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  30.43 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0326  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  26.12 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  27.27 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  31.75 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  30 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3089  response regulator receiver domain-containing protein  31.48 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0429158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  24.81 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  27.48 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  26.47 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  26.67 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  32.65 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  25 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  30.16 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>