More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3504 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  91.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4071  DNA-binding transcriptional activator UhpA  89.8 
 
 		 196 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  89.8 
 
 		 196 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4179  DNA-binding transcriptional activator UhpA  89.8 
 
 		 196 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4000  DNA-binding transcriptional activator UhpA  89.8 
 
 		 196 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.348805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  89.29 
 
 		 196 aa  360  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  87.24 
 
 		 197 aa  355  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  66.49 
 
 		 196 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  65.97 
 
 		 196 aa  257  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  65.97 
 
 		 196 aa  257  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 196 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000091  transcriptional regulatory protein UhpA  63.08 
 
 		 202 aa  244  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 211 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  50.51 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  48.74 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  48.74 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.74 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.45 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0836  two component LuxR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  45.79 
 
 		 209 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  39.3 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  38.81 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  38.81 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  36.32 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  36 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  36.63 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  40.7 
 
 		 209 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  35.5 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 215 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  35.96 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  35.64 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35.96 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  37.13 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  35.32 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  33.33 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  34.83 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>