More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2202 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  76.42 
 
 		 213 aa  334  7e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  47.6 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  47.6 
 
 		 210 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  49.04 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 218 aa  177  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  39.9 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 210 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.76 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  37 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>