More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0132 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  85.2 
 
 
196 aa  338  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  85.2 
 
 
196 aa  338  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  84.69 
 
 
196 aa  337  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  67.02 
 
 
197 aa  261  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  257  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4000  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.348805  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4071  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4179  DNA-binding transcriptional activator UhpA  65.28 
 
 
196 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  64.77 
 
 
196 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  64.77 
 
 
196 aa  254  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000091  transcriptional regulatory protein UhpA  59.28 
 
 
202 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 
211 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  47.45 
 
 
208 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  46.67 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  46.67 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.72 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.72 
 
 
218 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  46.6 
 
 
209 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0836  two component LuxR family transcriptional regulator  45.03 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.29 
 
 
215 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  41.29 
 
 
215 aa  130  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  36.84 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  35.5 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  35 
 
 
218 aa  128  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  35 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  35 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  35 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  35 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.41 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  37.31 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  36 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  34.83 
 
 
226 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.22 
 
 
239 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
211 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  35.18 
 
 
214 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  35 
 
 
218 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  35 
 
 
218 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  35 
 
 
218 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  35 
 
 
218 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 
214 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  35.18 
 
 
218 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
209 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  33.17 
 
 
214 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  35.32 
 
 
214 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
221 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 
220 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  36.14 
 
 
216 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  35 
 
 
214 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  34.17 
 
 
227 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
209 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  36.45 
 
 
218 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  32.66 
 
 
214 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  37.31 
 
 
215 aa  121  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  34.67 
 
 
218 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 
215 aa  121  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
212 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
233 aa  121  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  33.5 
 
 
218 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
213 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  35 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  35.18 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  34.67 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  35.18 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  35.18 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35.96 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 
220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
213 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 
244 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>