More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0836 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0836  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  81.34 
 
 		 209 aa  329  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  75 
 
 		 209 aa  316  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  75 
 
 		 218 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.95 
 
 		 211 aa  305  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 209 aa  297  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  69.38 
 
 		 209 aa  297  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  69.38 
 
 		 209 aa  297  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  61.17 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000091  transcriptional regulatory protein UhpA  50 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  50.49 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4071  DNA-binding transcriptional activator UhpA  50.49 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4000  DNA-binding transcriptional activator UhpA  50.49 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.348805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4179  DNA-binding transcriptional activator UhpA  50.49 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  50.49 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 196 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  48.28 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  48.28 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  49.02 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  47.55 
 
 		 197 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  47.29 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  39.23 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  38.65 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  36.45 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 210 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 239 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 210 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 215 aa  133  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  34.95 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  38.03 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 210 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  38.65 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  39.22 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 213 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>