More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2482 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  81.55 
 
 		 209 aa  344  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  81.55 
 
 		 218 aa  343  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  73.79 
 
 		 209 aa  310  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  73.79 
 
 		 209 aa  310  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  73.79 
 
 		 209 aa  310  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0836  two component LuxR family transcriptional regulator  72.6 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  73.06 
 
 		 209 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  61.72 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000091  transcriptional regulatory protein UhpA  49.03 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.52 
 
 		 196 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4071  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.52 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4000  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.52 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.348805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.52 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4179  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.52 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  51.02 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  50 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  50 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  37.8 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  37.14 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  35.89 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  33.99 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  36.28 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  35.71 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  36.32 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  35.71 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35.71 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  35.71 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  38.65 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  37.14 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  35.71 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  35.71 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>