More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4971 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 137 aa  286  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  46.97 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  39.71 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  37.31 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  37.7 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  32.33 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  34.13 
 
 		 320 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  32.8 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  33.33 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  32.8 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  41.49 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  31.39 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  36.09 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  32.82 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.54 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.07 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 927 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 397 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  32.03 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 531 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  31.5 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  34.13 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.33 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  37.61 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 783 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  31.54 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  32.82 
 
 		 531 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 391 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  35.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.24 
 
 		 1218 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  28.03 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>