More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1356 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  100 
 
 		 136 aa  280  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  32.33 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  31.43 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  33.33 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  33.61 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  33.08 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  31.15 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  30.53 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  34.11 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  22.95 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  27.05 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  25.6 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1016 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1672  response regulator receiver protein  30 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  32.98 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3098  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  21.88 
 
 		 491 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 250 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 397 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 477 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  36.36 
 
 		 685 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 		 657 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 476 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1813  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 542 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 483 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2598  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0703  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  24.8 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  29.63 
 
 		 1347 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 469 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 299 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  23.08 
 
 		 226 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1796  histidine kinase  28.12 
 
 		 577 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0313  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0254543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 		 778 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1567  response regulator receiver protein  28 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 395 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  28.26 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  21.09 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 1629 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 525 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 395 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2635  response regulator receiver domain-containing protein  26.72 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0563539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  29.01 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  35.63 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4041  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 533 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2264  response regulator receiver  30.95 
 
 		 273 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  32.89 
 
 		 381 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 		 1203 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.84 
 
 		 384 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 421 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  28.36 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3071  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 304 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000348024  unclonable  0.0000000210343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  28.79 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5022  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3092  response regulator receiver protein  25 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 338 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  26.56 
 
 		 504 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  34.85 
 
 		 339 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  25.58 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 2072 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 338 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0720  two component transcriptional regulator  23.62 
 
 		 236 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 338 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 338 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  24.03 
 
 		 227 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>