More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3706 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 226 aa  443  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  55.46 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  52.19 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  53.78 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  46.02 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.83 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  48.21 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  47.32 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  45.78 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  44.21 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  43.86 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.19 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.19 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  46.9 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.19 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  45.85 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  40.87 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  43.72 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  43.69 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  38.16 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  42.06 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  37.72 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.3 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.19 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  39.13 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  39.5 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  45.62 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  32.77 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.61 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  33.91 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  32.89 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.83 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  39.65 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  35.93 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.65 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  32.89 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  32.89 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  44.3 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  41.59 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  32.46 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  32.46 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  32.46 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  32.89 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  36 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.18 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  33.33 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  35.93 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  33.04 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.17 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  38.05 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  43.42 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  32.17 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  32.17 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.91 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.91 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.05 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  40.52 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  31.33 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  31.33 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  32.19 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  34.48 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  40.52 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  33.05 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  34.48 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.48 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.05 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  34.2 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  31.76 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.03 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2305  response regulator receiver and unknown domain protein  43.61 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  31.76 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.03 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.03 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.03 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.48 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.03 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  31.76 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0520  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.6 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  32.19 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  33.48 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.91 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.8 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  31.58 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  31.76 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.91 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  29.46 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>