More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4937 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  36.59 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  32.56 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  35.71 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  32.33 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  37.5 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  31.06 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  30.77 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  33.33 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  34.71 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  32.35 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  33.33 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  33.61 
 
 		 368 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  28 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  33.85 
 
 		 368 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  33.08 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.61 
 
 		 342 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  31.06 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  31.06 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  31.06 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.4 
 
 		 696 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 143 aa  57  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  29.37 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  31.06 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  31.06 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  32.52 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.62 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0891  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  28.71 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 564 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1269  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.019586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  29.63 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 846 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  32.11 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  33.67 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  34 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  29.91 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  34 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 948 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 229 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3277  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>