More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5434 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  266  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  33.86 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  37.7 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  35.2 
 
 		 320 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  32.8 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  34.62 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  36.54 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  29.03 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  32 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  31.5 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  22.95 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  28.91 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  29.31 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 531 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  30.89 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  26.61 
 
 		 671 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 		 899 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1016 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.61 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 963 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  32.47 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  31.62 
 
 		 368 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 		 1691 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  30 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  27.05 
 
 		 2312 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 781 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.83 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  28.35 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  29.06 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 383 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 237 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 383 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  26.4 
 
 		 1834 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  28.35 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 1255 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  29.1 
 
 		 1127 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3139  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 376 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  26.27 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  29.69 
 
 		 384 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  28.21 
 
 		 368 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3172  response regulator receiver  30.95 
 
 		 374 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0051  histidine kinase  32.35 
 
 		 760 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 		 1266 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 225 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 236 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1609 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 236 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1889  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>