More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6527 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  37.01 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  29.41 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  27.94 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  31.71 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  32.32 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  27.91 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  31.2 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  26.15 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3706  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322274  normal  0.186621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  28.24 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  29.41 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 289 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 202 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  30.65 
 
 		 367 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  38.55 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  30 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.8 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  25 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  27.56 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  26.6 
 
 		 251 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2982  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  24.59 
 
 		 520 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  32.58 
 
 		 356 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2635  response regulator receiver domain-containing protein  26.5 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0563539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  27.05 
 
 		 1351 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  34.38 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.33 
 
 		 466 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1400  response regulator of RpoS  31.73 
 
 		 337 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01211  response regulator of RpoS  31.43 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01221  hypothetical protein  31.43 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 421 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2392  response regulator of RpoS  31.43 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1720  response regulator of RpoS  31.43 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1906  response regulator of RpoS  31.43 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174648  normal  0.215745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1343  response regulator of RpoS  31.43 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1384  response regulator of RpoS  31.43 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.421294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  30.08 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0886  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384988  normal  0.153587 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  32.69 
 
 		 685 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  34.72 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2169  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23773  normal  0.234658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  25 
 
 		 797 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  27.83 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2598  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  30 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  30.21 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>