More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1627 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  100 
 
 		 320 aa  653    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  31.75 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  34.13 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  44.59 
 
 		 132 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 141 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  30 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  31.15 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2305  response regulator receiver and unknown domain protein  30.91 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  32.54 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0001  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 118 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  30.36 
 
 		 969 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 1070 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  34.15 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 1070 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  30.3 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.27 
 
 		 2284 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  32.76 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0533  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.58 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.985347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45485  ethylene receptor 1  30 
 
 		 833 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  30.47 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  35.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  35.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2999  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.669597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11558  two-component system response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  32.52 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1796  histidine kinase  35.19 
 
 		 577 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.84 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  27.68 
 
 		 971 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2080  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.51 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000557  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4185  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 159 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  25.44 
 
 		 1834 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2401  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3705  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 628 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.567264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.04 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 128 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 1203 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 523 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4655  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.82 
 
 		 593 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.82 
 
 		 593 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04606  two-component system regulatory protein  29.63 
 
 		 157 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  29.36 
 
 		 1987 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 944 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  30.7 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 515 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 1074 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  25.4 
 
 		 146 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2585  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.87 
 
 		 449 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  32 
 
 		 132 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  27.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0710  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 406 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 143 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  25.45 
 
 		 227 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.62 
 
 		 715 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  30.48 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1276  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 449 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  30 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 860 aa  53.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 423 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.82 
 
 		 1020 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07851  hybrid sensory kinase  31.4 
 
 		 730 aa  53.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  35.62 
 
 		 117 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  26.96 
 
 		 223 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  25.71 
 
 		 1992 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 138 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 406 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 226 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05331  transcriptional regulatory protein CpxR  32.71 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  30 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2804  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 494 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.96 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>