More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0054 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  38.24 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  37.31 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  34.43 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  34.92 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  32.33 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  36.29 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  35.83 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  30.53 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  30.3 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  30.91 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  32.28 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  34.17 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  30.71 
 
 		 531 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1944  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 924 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2247  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 924 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.6065  hitchhiker  0.0077102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  25.78 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  31.85 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 516 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1949  secretion system regulator:Sensor component  29.37 
 
 		 920 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.14133  normal  0.0293966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 948 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 531 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  30 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 531 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1505  secretion system regulator:Sensor component  28.57 
 
 		 920 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1490  secretion system regulator:Sensor component  28.57 
 
 		 920 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1527  secretion system regulator:Sensor component  28.57 
 
 		 920 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0140135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1779  secretion system regulator:Sensor component  28.57 
 
 		 920 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.255044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 869 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 835 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 606 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  33.98 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 508 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  25.81 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  33.98 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1805  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  30.88 
 
 		 602 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 869 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  27.78 
 
 		 1001 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  30.99 
 
 		 1082 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1082 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 		 951 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  30.99 
 
 		 1082 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>