More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05331 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05331  transcriptional regulatory protein CpxR  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000557  DNA-binding response regulator  88.26 
 
 		 230 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3280  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 228 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000001291  hitchhiker  0.0000698043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3065  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 		 237 aa  208  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00140102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  42.73 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.05 
 
 		 234 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  43.97 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 237 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  42.98 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 234 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  42.86 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 234 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 236 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 236 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.07 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 240 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 242 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  39.64 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  40.53 
 
 		 232 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 238 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.39 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.13 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 238 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 232 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0097  hypothetical protein  39.3 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0268047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.7 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.7 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  38.7 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  38.7 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.7 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  38.7 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  38.7 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.7 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 235 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  36.25 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  38.43 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 233 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  36.77 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  36.75 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  36.86 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  34.82 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  36.68 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  35.78 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  36.24 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>