More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3065 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3065  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00140102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3280  DNA-binding response regulator  57.33 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000001291  hitchhiker  0.0000698043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000557  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05331  transcriptional regulatory protein CpxR  50.44 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  45.92 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  45.49 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  46.22 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.05 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.74 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 249 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  42.92 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  42.92 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.33 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 236 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  40.09 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  40.43 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  41.33 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  38.67 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  40.81 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  39.55 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0097  hypothetical protein  42.6 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0268047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  40 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  36.52 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  38.43 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  38.46 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  38.01 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1261  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>