More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3216 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  32.8 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  34.88 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  37.3 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  35.83 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  36.11 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  32.8 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  30 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  27.64 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  32.26 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  29.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  29.23 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  25.6 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  29.03 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  30.77 
 
 		 531 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1513  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  29.51 
 
 		 504 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  29.23 
 
 		 847 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  32.81 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 383 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  29.82 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 707 aa  53.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4605  response regulator receiver domain-containing protein  26.02 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 479 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 531 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  26.45 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  28.07 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  29.55 
 
 		 368 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 566 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 383 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 734 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  25.98 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  29.84 
 
 		 797 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 383 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 		 348 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  36.97 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1159 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  23.62 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  27.19 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.59 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2393  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 518 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  0.0787545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  27.19 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 355 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  30.3 
 
 		 368 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0381  response regulator, histidine kinase  30.3 
 
 		 735 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 221 aa  50.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  24.41 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>