More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2393 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2393  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 518 aa  1064    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  0.0787545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1691 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  38.36 
 
 		 544 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 		 801 aa  319  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 		 791 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 1313 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 		 1075 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 		 969 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 		 911 aa  302  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 674 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 		 968 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 882 aa  296  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 1120 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 1271 aa  293  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 		 780 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 1027 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.47 
 
 		 1177 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 764 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  40.42 
 
 		 550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 		 667 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  34.77 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1132 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  32.73 
 
 		 598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 773 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 1116 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 957 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 995 aa  273  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 868 aa  273  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.79 
 
 		 1120 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 1070 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 932 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 940 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 		 685 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  33.02 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 803 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 		 1118 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  40.05 
 
 		 736 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 743 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 846 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 907 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 863 aa  266  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 383 aa  266  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 662 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.79 
 
 		 853 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  38.42 
 
 		 882 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1199 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 627 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  38.13 
 
 		 732 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 873 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40 
 
 		 968 aa  263  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.53 
 
 		 651 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  40.35 
 
 		 1193 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  39.07 
 
 		 1111 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  40.05 
 
 		 810 aa  262  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 		 738 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1121 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 717 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 573 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 631 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.32 
 
 		 651 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  33.91 
 
 		 578 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  40.41 
 
 		 2109 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 		 765 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  38.1 
 
 		 984 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  38.73 
 
 		 667 aa  259  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  38.73 
 
 		 667 aa  259  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  33.91 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 1078 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 973 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.95 
 
 		 631 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 827 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1079 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 881 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  41.28 
 
 		 666 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 871 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  38.68 
 
 		 445 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 741 aa  256  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 1433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 822 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 896 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 627 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 604 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  36.84 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 817 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  37.4 
 
 		 697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.65 
 
 		 763 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6238  histidine kinase  33.27 
 
 		 519 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 827 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 		 645 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 873 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 877 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 772 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.64 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1055 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 939 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 876 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1118 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 957 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1287 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>