More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3047 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  100 
 
 		 135 aa  281  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  46.97 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  38.52 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  36.15 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  31.75 
 
 		 320 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  34.92 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  32.28 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  36.07 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  33.61 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  27.64 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  43.06 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  36.15 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 397 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  30.47 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  33.58 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  36 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  31 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2037  response regulator receiver domain-containing protein  28.46 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0651814  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 606 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 1832 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  29.46 
 
 		 150 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.37 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  31.18 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0829  response regulator receiver domain-containing protein  27.87 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0491028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 945 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  28.97 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 299 aa  50.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1736 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 1127 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 933 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  28.03 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  28.69 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  28.69 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 531 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 935 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  29.6 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1695  GacS/BarA family sensor protein  28.57 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  42.86 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.28 
 
 		 1180 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>