More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2335 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  100 
 
 		 146 aa  300  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  39.71 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  38.52 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  32.33 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  31.43 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  31.85 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  37.01 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  32.08 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  29.69 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  35.2 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  32.26 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  35.45 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  30.89 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  30.53 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  28.12 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  31.3 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  25.4 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0886  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384988  normal  0.153587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.71 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  29.1 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  26.98 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3139  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3223  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.186882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1038  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0159  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0749254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  26.76 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  25 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 162 aa  50.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  28.97 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  25.6 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4406  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.31 
 
 		 483 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>