More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1524 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  34.43 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  33.33 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  32.28 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  33.33 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  32 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  30.53 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  29.03 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  30.47 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  40.26 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  31.82 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  24.8 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1949  secretion system regulator:Sensor component  28.71 
 
 		 920 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.14133  normal  0.0293966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1490  secretion system regulator:Sensor component  28.71 
 
 		 920 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1527  secretion system regulator:Sensor component  28.71 
 
 		 920 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0140135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1505  secretion system regulator:Sensor component  28.71 
 
 		 920 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1779  secretion system regulator:Sensor component  28.71 
 
 		 920 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.255044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  28.26 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 1201 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 811 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2126  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438867  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  26.02 
 
 		 395 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 1204 aa  50.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  26.77 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03214  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 852 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal  0.573276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0135  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  26.77 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.33 
 
 		 1834 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  27.56 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.1 
 
 		 906 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.01 
 
 		 2213 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 		 942 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1744  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 229 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  28.8 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 		 930 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 		 921 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2211  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  29.77 
 
 		 2051 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  31.75 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  30 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4204  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4132  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4336  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.13 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  26.4 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1407 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  28.71 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  36 
 
 		 371 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  30.63 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.21 
 
 		 354 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 920 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  35.06 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  25.2 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.12 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>