More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3028 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  38.24 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  33.33 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  37.3 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  36.07 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  32.8 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  37.01 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  32.8 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  33.04 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  36.8 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  27.05 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  31.68 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  30.77 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.35 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  31.15 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  30 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0891  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  30.33 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1137 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  28.12 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  25 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  29.41 
 
 		 1137 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  30.89 
 
 		 803 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  28.71 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1944  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 924 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  27.05 
 
 		 320 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  29.59 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  26.12 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3581  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.13 
 
 		 426 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 394 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  30.47 
 
 		 1001 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  30.3 
 
 		 1834 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.25 
 
 		 696 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 1816 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>